Đến ngày 20-3-2005, John Couey được di lí về Lecanton, bang Florida, và được đặt trong tình trạng giám sát tự tử. Ba đối tượng khác là Dorothy Dixon, Madie Secord, và Matthew Dittrich bị cáo buộc tội che giấu tội phạm. Vụ việc đã khiến người dân Homosassa giận giữ và bất kì ai theo dõi vụ án này đều đòi hỏi công lí phải được thực thi.
Trong khi đó, cố gắng kìm nén nỗi đau, Mark Lunsford, cha của nạn nhân, đã vận động cơ quan lập pháp bang Florida thiết lập những đạo luật chặt chẽ hơn để bảo vệ những em nhỏ khác khỏi những đối tượng tấn công tình dục, như Couey. Đến ngày 2-5-2005, đạo luật Jessica Lunsford đã được nhanh chóng thông qua và kí thành luật bởi Thống đốc Jeb Bush. Đạo luật chính thức có hiệu lực từ ngày 1-9-2005.
Trở lại vụ án của Couey, phía công tố ngày 1-4 chính thức cáo buộc bị cáo John Couey phạm các tội danh giết người cấp độ 1, bắt cóc, lạm dụng tình dục và trộm cướp. Trong khi đó, những cáo buộc đối với các đồng phạm khác đã được hủy bỏ. 5 ngày sau đó, Couey xuất hiện tại tòa và tuyên bố mình vô tội. Tuy nhiên, phía công tố khẳng định sẽ yêu cầu tòa ra phán quyết tử hình bị cáo. Trong thời gian tranh tụng, Couey không được xét bảo lãnh tại ngoại và bị biệt giam tại nhà tù của hạt. Mùa Xuân năm 2006, phiên tòa xét xử Couey diễn ra. Trong phiên xét xử sơ thẩm, thẩm phán Richard Howard đã giáng một đòn đối với nỗ lực của phía công tố viên khi cho rằng lời khai của Couey đối với các thám tử ở Augusta là không thích hợp bởi họ đã liên tục từ chối đòi hỏi luật sư của bị cáo. Cho đến lúc này, việc lựa chọn thành viên đoàn bồi thẩm trở nên căng thẳng đến mức, một số ứng cử viên cho biết đã bị đe dọa về tính mạng nếu như không khẳng định Couey là có tội. Một lần nữa, địa điểm xét xử Couey lại được thay đổi. Và phiên tòa được ấn định diễn ra vào ngày 12-2-2007 tại hạt Miami-Dade. Tại đây, các bằng chứng được phía công tố đưa ra bao gồm DNA trong máu của Jessica và tinh trùng của Couey trên tấm ga giường ngủ của hắn cũng như dấu vân tay của nạn nhân tìm thấy trong tủ ngôi nhà lưu động. Phía luật sư biện hộ tìm cách chứng minh rằng tiền sử nghiện rượu và ma túy cũng như chứng bệnh tâm thần lâu nay cũng như việc bị ngược đãi về tinh thần trong suốt cuộc đời của bị cáo chính là nguyên nhân đẩy Couey vào hành động bắt cóc, giết người. Theo họ, chỉ số IQ thấp dưới mức bình thường của Couey cho thấy bị cáo có vấn đề về tâm thần, và theo phán quyết của Tòa án Tối cao Mỹ năm 2002, Couey sẽ không phải chịu mức án tử hình. Tuy nhiên, chủ tọa phiên tòa đã khẳng định rằng kết quả kiểm tra IQ của Couey ở mức 78, còn cao hơn mức bị coi là đần độn tới 8 điểm. Ngày 7-3-2007, bồi thẩm đoàn tuyên bố thành lập mọi tội danh liên quan đến cái chết của nạn nhân Jessica Lunsford, đối với bị cáo John Couey. Đến ngày 11-8, với tỷ lệ phiếu 10-2, bồi thẩm đoàn xác nhận Couey sẽ phải chịu mức án tử hình và theo luật pháp bang Florida, một phiên tòa sẽ diễn ra để tranh luận về việc bị cáo có phải nhận mức án này hay không. Kết quả là bị cáo sẽ phải thi hành phán quyết này. Tuy nhiên, đến ngày 30-9-2009, John Couey đã bất ngờ chết trong tù với nguyên nhân tự nhiên.