Nếu kết hôn cùng quan hệ huyết thông, khả năng con cái của họ bị mắc bệnh lặn cao hơn nhiều lần so với hôn nhân không cùng quan hệ và khả năng kết hôn cùng quan hệ sinh ra những đứa con dị tật cũng cao hơn. Do đó, ở một số quốc gia, hôn nhân cùng huyết thống bị nghiêm cấm hoặc những người có quan hệ huyết thống trong vòng ba đời.
Tuy nhiên, ở nhiều quốc gia và khu vực, chẳng hạn như Nhật Bản, nơi mà nhiều người trong chúng ta quen thuộc, luôn cho phép những người họ hàng thân thiết kết hôn, đặc biệt là hoàng gia Nhật Bản rất khăng khăng vấn đề kết hôn họ hàng thân thiết.
Hoàng gia Nhật Bản đã trải qua quá trình lâu dài và hệ thống hoàng đế của nó vẫn tồn tại cho đến ngày nay. Tuy nhiên, trong quan niệm của người Nhật rất coi trọng độ tinh khiết của máu, đặc biệt là huyết thống hoàng tộc, được đặt lên hàng đầu. Chính vì vậy, hoàng gia Nhật Bản có rất nhiều cuộc hôn nhân cận huyết thống trong vấn đề hôn nhân, để con cháu nối dõi tông đường với mong muốn duy trì thuần huyết.
Thời xa xưa, hoàng gia Nhật Bản cũng từng có hoàng đế kết hôn với em gái ruột của mình, nhưng đó chỉ là vì tình yêu chứ không phải vì sự trong trắng của huyết thống. Mặc dù hôn nhân cùng quan hệ được cho phép vào thời điểm đó, nhưng nó đã bị chỉ trích. Vì vậy, những năm sau này, về cơ bản, họ tìm kiếm hôn nhân giữa những người thân ngoài.
Tuy nhiên, trong các cuộc hôn nhân chính chủ của Nhật Bản, ngoài những người tìm kiếm hôn nhân giữa những người họ hàng cùng thế hệ, đôi khi thực sự không có sự lựa chọn và họ sẽ chọn kết hôn qua nhiều thế hệ, chẳng hạn như kết hôn với cháu gái của chính mình để "giữ gìn huyết thống trong sáng"
Trên thực tế, ngoài Nhật Bản, ở châu Âu và châu Mỹ đều cho phép kết hôn cùng quan hệ vợ chồng, quốc gia có tỷ lệ kết hôn đồng giới cao nhất là Tunisia. Đất nước này không quá quen thuộc với nhiều người, chỉ là một quốc gia nhỏ ở Bắc Phi, kết hôn tại địa phương 13%, khá cao.
Tuy nhiên, nhiều người có thể tò mò: Vì rất nhiều người ở Nhật Bản và những nơi khác kết hôn với họ hàng gần, tại sao họ lại có thể có con bình thường? Trên thực tế, tỷ lệ phổ biến này đương nhiên tồn tại, nhưng có một số lý do giải thích tại sao không có quá nhiều hậu duệ "dị dạng" trong hoàng gia Nhật Bản.
Trong hoàng gia Nhật Bản, có các bác sĩ cực kỳ uy quyền trong nước làm hỗ trợ, và trong quá trình sinh sản con cái sẽ được hỗ trợ y tế nâng cao. Dù là trước khi đứa trẻ được sinh ra hay sau khi đứa trẻ được sinh ra đều sẽ được kiểm tra cực kỳ kỹ lưỡng, nếu có vấn đề gì sẽ được giải quyết ngay trong thời gian đầu, vì vậy việc sinh con ra đời được kiểm soát chặt chẽ. Những đứa trẻ mắc bệnh và dị tật thực sự về cơ bản sẽ không đến thế giới này.
Tất nhiên, trong hoàng gia Nhật Bản, các cuộc hôn nhân cận huyết thống thường không trong vòng 3 thế hệ, điều này cũng giảm bớt một số rủi ro cho các thế hệ sau.
Trong mọi trường hợp, hoàng gia Nhật Bản muốn đảm bảo dòng máu hoàng tộc trong sạch, để theo đuổi hôn nhân cùng quan hệ huyết thống, nhưng cái gì cũng có cái được và cái mất, rủi ro vẫn tồn tại.