Nguyên nhân ban đầu được biết do có sự mâu thuẫn giữa học sinh D.A với giáo viên. Đến giờ ra chơi, em đã uống hết một lọ thuốc diệt cỏ. Ngay sau đó, có biểu hiện nôn nhiều lần. Nhà trường thông báo với gia đình kịp thời đưa em đến bệnh viện Bạch Mai (Hà Nội) cứu chữa.
Bước đầu, các bác sĩ tiến hành rửa ruột, lấy nước tiểu xét nghiệm, đồng thời tiến hành biện pháp lọc máu. Tuy nhiên, thông tin từ bác sĩ trực ca cho biết, chai thuốc diệt cỏ này là loại rất độc hại. Một chai thuốc đủ để giết chết 20 người, chỉ với một ngụm nhỏ đã đủ gây chết người.
Mẹ học sinh D.A cho biết, sáng sớm em còn vui vẻ uống sữa rồi đi học. Gia đình không hề biết động cơ tự tử của em. Cô cho biết thêm, gia đình không làm nông nghiệp nên không có thuốc diệt cỏ trong nhà. Có thể em đã mua ở một cửa hàng bán thuốc bảo vệ thực vật nào đó. Bác sĩ - thạc sĩ Nguyễn Trung Nguyên, trung tâm chống độc bệnh viện Bạch Mai khuyến cáo, tuyệt đối không nên sử dụng thuốc diệt cỏ. Trên thế giới nói chung và ở Việt Nam nói riêng, những trường hợp sống sót khi sử dụng thuốc diệt cỏ là rất hiếm. Trường hợp sống sót thường để lại những tai biến nặng nề như liệt, thần kinh… Hiện các bác sĩ tại Bệnh viện Bạch Mai vẫn đang theo dõi và cứu chữa hết mình đối với học sinh D.A. Cơ quan chức năng vẫn đang tiếp tục điều tra nguyên nhân dẫn đến việc học sinh này phải tự tử.